MAGI: excelente aplicación que permite a los científicos estudiar la genética del cánc

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MAGI: excelente aplicación que permite a los científicos estudiar la genética del cánc

Hoy en día, la tecnología ha mejorado tanto que tenemos una aplicación para casi todo, como las aplicaciones para noticias, redes sociales, banca, entretenimiento, etc. Ahora la noticia es que, los científicos de la Universidad Brown han creado una aplicación llamada MAGI (Anotación de mutación e Interpretación del genoma) mediante la cual los usuarios pueden comparar sus resultados con varios conjuntos de datos genéticos de cáncer.

Básicamente, ‘MAGI’ es una aplicación de código abierto e interactiva que permite a los médicos e investigadores investigar los pasajes del cáncer. Con esta herramienta, los usuarios pueden buscar, visualizar y también interpretar conjuntos de datos genéticos de cáncer públicos, incluidos los datos del proyecto TCGA (The Cancer Genome Atlas). Junto con los datos de TGCA, la aplicación también le permite cargar sus propios datos y comparar los resultados con los de la base de datos.

¿Por qué se desarrolla ‘ MAGI ‘?

De acuerdo con Max Leiserson, el desarrollador líder de MAGI, la aplicación permite a los usuarios explorar datos genómicos del cáncer usando un navegador web normal, incluso si él / ella no tiene experiencia en computación. También dice que la carga computacional de los médicos e investigadores ha sido la razón principal para el desarrollo de una aplicación tan sorprendente.

Durante los últimos diez años, muchos investigadores que trabajan en TCGA han secuenciado los genes de aproximadamente miles de tumores y tipos de cáncer para comprender las mutaciones que contribuyen al desarrollo del cáncer. Este esfuerzo detrás del análisis motivó a los científicos de la Universidad de Brown, que llevaron al desarrollo de MAGI.

¿Qué tan útil ha sido la aplicación?

La aplicación realmente ha sido útil para los clínicos e investigadores de laboratorio. Hoy en día, la secuenciación de genes también se ha vuelto más rápida y barata; los investigadores en realidad han comenzado a secuenciar las muestras en función de sus propios estudios y, a veces, con referencia a unos pocos tumores. Pero ahora, pueden cargar los resultados a MAGI y pueden hacer uso de los enormes conjuntos de datos públicos para interpretar sus propios datos.

Según Ben Raphael, el Director de la Universidad de Brown, las mutaciones son diversas y se extienden por todo el genoma. Por lo tanto, en los genomas del cáncer, el valor real reside en los tamaños de muestra grandes. También explica que, si hubiera secuenciado algunos genomas de cáncer de un banco local de tumores, lo primero que haría sería comparar sus datos con los enormes conjuntos de datos públicos en busca de similitudes. La salida generada por MAGI ofrece varias formas de visualizar los resultados. También muestra con qué frecuencia se muta un gen a través de las muestras y otra información.

Como ya se dijo anteriormente, hoy la secuenciación de genes se ha vuelto más rápida para que los técnicos de laboratorio y los investigadores puedan usar los datos genómicos para diagnosticar y también para desarrollar un curso de tratamiento para una variedad de cánceres. El objetivo del laboratorio es hacer que la aplicación esté disponible de forma gratuita para que aquellos que se encuentran en la comunidad genómica del cáncer puedan hacer uso de ella.

Actualmente, las aplicaciones móviles están desempeñando un papel vital, aparte de las aplicaciones de juegos y entretenimiento, como las noticias, las aplicaciones relacionadas con la salud ayudan a los usuarios a saber más sobre los problemas de salud.

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